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2018年自然資源部成立后，鐘自然任自然資源部黨組成員，中國地質調查局局長、黨組書記。直至2022年9月卸任。今年1月2日，即2024年首個工作日，其官宣被查。
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公器私用，將地質調查、礦產開發等權力作為斂財納賄的工具，搞權錢交易，利用職務便利為他人在企業經營、項目承攬、礦權審批等方面謀利，并非法收受巨額財物；
澳門燭龍論壇6月21日，中央紀委國家監委發布消息，自然資源部原黨組成員，中國地質調查局原黨組書記、局長鐘自然被開除黨籍，涉嫌受賄、故意泄露國家秘密犯罪問題移送檢察機關依法審查起訴。
